转基因南瓜品种主要包括以下几种：
转基因抗虫耐除草剂南瓜 ‘MDR1’：该品种对烟粉虱和蚜虫具有抗性，同时耐除草剂，可减少杀虫剂的使用量。
转基因耐旱耐寒南瓜 ‘PFR-2’：该品种能够在干燥和寒冷环境中生长，同时耐旱、耐寒性能好，适合在环境恶劣的地区种植。
转基因抗虫南瓜 ‘Cpr5’：该品种对多种害虫具有抗性，如蚜虫、粉虱等，可减少杀虫剂的使用。
转基因耐除草剂南瓜 ‘Hercule2’：该品种具有广谱的除草剂抗性，可抵御多种除草剂，降低因误用除草剂造成的损失。
转基因抗病南瓜 ‘PFR-1’：该品种对多种病害具有抗性，如疫病、炭疽病等，可提高产量和品质。
需要注意的是，关于转基因植物的争议一直存在，包括其安全性、生态风险和环境影响等。因此，在种植和推广转基因植物时，需要加强风险评估和安全管理，确保其安全性和可持续性。
目前市面上并无转基因南瓜流通。
目前市面上贩卖的南瓜品种都是通过种子育苗栽培的，没有改变南瓜基因的情况出现，食用后对身体也无伤害，可以放心食用。
转基因南瓜是将其他植物的基因转移到南瓜中，改变南瓜的生物特性和基因，考虑食用后对身体或有影响，转基因食品的商用推广并未展开。
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