属杂食性鱼类，喜欢捕食以浮游生物、小型甲壳动物、昆虫、扁螺和高等植物的碎屑及藻类等，有时也取食水底腐殖质或泥渣。
在饲养时，可投喂麦麸、米糠、花生饼、豆饼、菜饼、蚯蚓、蝇蛆及浮萍等植物性饲料，适当搭配少量鱼粉、蚕蛹等
溪流鳅爱吃的动物性饵料有小鱼、小虾、螺、蚌、黄粉虫、蚯蚓、蝇蛆、蚕蛹、蜗牛、禽畜下脚料、小杂鱼肉、水生昆虫等。这些饵料营养丰富，转化率高，有利于溪流鳅的生长发育。
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