野生甲鱼与养殖的甲鱼主要有四点区别：一是野生甲鱼外表黑中略带黄绿色，人工饲养的是黑色；二是野生甲鱼因生长在有泥的池塘、河流、湖泊里，脚爪通常都比较锋利，而人工饲养的甲鱼生长在水泥池中，所以后者的脚爪磨得较钝；三是野生甲鱼的裙边都比较宽厚，人工饲养的甲鱼裙边既薄又窄；四是野生甲鱼体内的脂肪呈黄色，而人工饲养的为白色。
、养殖甲鱼背上粗糙，不光滑，裙边（也叫飞边，位于甲鱼周围，是甲鱼身上滋味最鲜美的部分）较薄，而野生甲鱼背上光洁平滑，裙边厚实；
2、养殖的甲鱼爪子不硬不尖，颜色发白，而野生甲鱼爪子又硬又尖，颜色发黄。
3、养殖甲鱼肚底发白发红，较嫩，而野生甲鱼肚皮发黑，条纹清楚，颜色发暗。
4、野生甲鱼油脂发黄，感觉富胶质，黏性很好；而养殖甲鱼油脂比较多呈淡白，黏性较差。
5、辨雌雄要看甲鱼的生殖器，超出裙边又大又粗的即为雄性，反之为雌性。雄甲鱼体薄肉厚；而雌甲鱼虽然体厚，但体内往往有许多甲鱼蛋，看似肥壮，一经剖开，则显得肉薄而空。
腹甲不同：野生甲鱼腹甲软骨弹性大，养殖甲鱼的腹部软骨弹性小。
体色差别：野生甲鱼的体色为灰黑色、土黄色，养殖甲鱼体色黑中带绿。
形体差异：野生甲鱼形体健壮，肌肉紧实，养殖甲鱼肌肉松软。
背爪区别：野生甲鱼爪子发黑，养殖甲鱼爪子发白
1、从甲背外表看。野生甲鱼甲背光洁平整，皮薄均匀，有蜡质光感，可隐现甲壳轮廊。而家养甲鱼甲背皮略厚，疣粒粗糙且无光质感，象蛤蟆皮不易看出甲壳轮廊。
2、从甲背颜色看。野生甲鱼有灰黑色、土黄色、褐底黑斑色等，而家养甲鱼则多呈黑中透绿色、黄中带绿色、绿青苔色等。
3、从体状外形看。野生甲鱼由于长期自然状态辛劳觅食，形体骄健，略显扁平，肌肉紧实。而家养甲鱼就显体态雍肿，肥厚笨拙，肌肉松软。
4、抵压腹甲。野生甲鱼腹软骨弹性强度较大，用手指抵压反弹力大。而家养甲鱼腹部软骨弹性弱，用手指抵压，感觉软塌，反弹无力。
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