龙眼树主要以采果且修剪为主，通常在采果后1个月内修剪完成。如树势弱的果树，采果后一般只抽1次梢，修剪时间可迟些，可以在8月下旬至9月上旬进行；如当年结果少，树势较壮，肥水条件好的龙眼树，则应该在采果后5~7天及时修剪，以促进秋梢早萌发，放2次秋梢；如低龄结果树在肥水充足的条件下，在采果后抽2次秋梢，修剪宜早不宜迟，适合在8月中旬采果后进行修剪；如当年没有结果的龙眼树，在7月下旬至8月上旬夏延秋梢抽生期进行修剪，修剪后能抽2~3次健壮秋梢，这类龙眼树修剪宜重剪。龙眼树采果后的修剪方法有以下5种。
1、疏除过密枝、荫枝、细弱枝、交叉重叠枝、下垂枝、严重病虫枝、枯枝等。
2、回缩衰退枝组，保留其基枝20~25厘米、径粗1.5~2.0厘米的枝桩。
3、短截衰弱的结果母枝和徒长枝，修剪程度以中午时可以看见阳光通过绿叶层，在树盘地面上形成数量众多的像铜钱大小的光点为宜。
4、交叉枝、丛生枝去弱留强进行疏剪。
5、弱枝轻剪或不剪，强枝可适当重剪。
一般龙眼树基枝抽发的新梢如过密，在新梢长度为5~10厘米时疏芽定梢，每一根枝条只保留生长强壮的新芽1~2条，其他的新芽全部摘掉，保证枝条健壮充实。
二、龙眼树冬季修剪
龙眼树冬季修剪主要是防止冬梢的抽生和控杀冬梢。防止冬梢抽生可通过秋季的水肥管理，使秋梢老熟后不再萌发冬梢，主要通过断根、环割、环剥、环扎、人工摘除冬梢，药物控制的方法来控杀冬梢。
三、龙眼树春夏季修剪
龙眼树春季修剪是指，在3月下旬剪掉生长的新芽和嫩叶，带叶的花穗则要摘除花穗夹带的嫩叶，过长的花穗要剪短，每个花穗留20厘米左右其余短截，保留侧花穗5~6枝。
如当年没有花果的龙眼树在4月中旬到5月上旬按秋季修剪和定芽的方法进行修剪和定芽。
一、幼树修剪
龙眼树的幼树也需要修剪，等到幼树成活之后，会长出很多新的枝叶，此时应剪掉过长的枝叶，杂乱、纤细的枝叶及时剪掉，这样能促进主枝干的生长，等长到一定程度后，可以对幼树进行整形修剪，能促进分枝、预备枝的生长，利于后期长成健壮的龙眼树。
二、春季修剪
龙眼树在春季需进行一次修剪，可选在早春时进行。春季修剪主要是以轻修剪为主，让树木能够保持一个比较好的树冠。春季需将无用的枝叶剪掉，可以结合疏花疏果进行，能促进生长，也能保证好产量和品质。需要注意，此次修剪不能修剪过重。
三、秋季修剪
秋季对龙眼树也需进行一次修剪，将树上长势有问题的枝条剪掉，长势过弱的枝叶也需剪掉，能减少养分的消耗，同时能增加透风性和透气性。采摘完龙眼后，需将龙眼树上的病虫枝、杂乱枝、过密枝、老枝、枯枝一并剪掉，能够调整好生长情况。
四、培养母枝
在龙眼采收之后，需要对新的结果枝进行预留，培育成壮枝，也就是母枝。将结果量少的结果枝剪除，控制结果枝的数量。
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