水产菌种对温度有一定的要求，不同的菌种会对温度有不同的适应范围。一般来说，水产菌种在适宜的温度下生长繁殖能力较强，而在过高或过低的温度下则会受到抑制甚至死亡。
例如，一些常见的水产菌种如青藻、褐藻等一般在15-25摄氏度的温度范围内生长最为适宜，而在较高的温度下则会生长受到抑制。因此，在水产养殖过程中，根据不同的菌种需求，合理控制水体温度是非常重要的。
温度适宜，使用温度是25℃以上为宜，水温低，菌种生长缓慢，无法迅速形成优势种，效果不理想。
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